Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ist1Q9CX00 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ist1Q9CX00 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ist1Q9CX00 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ist1Q9CX00 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.1 ms