Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RpainQ9CWY9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RpainQ9CWY9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RpainQ9CWY9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RpainQ9CWY9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms