Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6kQ9CWP4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6kQ9CWP4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6kQ9CWP4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6kQ9CWP4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6kQ9CWP4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ly6kQ9CWP4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ly6kQ9CWP4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ly6kQ9CWP4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ly6kQ9CWP4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ly6kQ9CWP4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ly6kQ9CWP4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms