Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR78

Msantd3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd3Q9CR78 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msantd3Q9CR78 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Msantd3Q9CR78 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msantd3Q9CR78 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Msantd3Q9CR78 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms