Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GsdmcQ99NB5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GsdmcQ99NB5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GsdmcQ99NB5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms