Protein–RNA interactions for Protein: Q91YW3

Dnajc3, DnaJ homolog subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc3Q91YW3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnajc3Q91YW3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dnajc3Q91YW3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnajc3Q91YW3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnajc3Q91YW3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnajc3Q91YW3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1187.8 ms