Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NifkQ91VE6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NifkQ91VE6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NifkQ91VE6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NifkQ91VE6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NifkQ91VE6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NifkQ91VE6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms