Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clip4Q8CI96 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clip4Q8CI96 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip4Q8CI96 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip4Q8CI96 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clip4Q8CI96 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip4Q8CI96 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms