Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd4aQ8BIE6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd4aQ8BIE6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd4aQ8BIE6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd4aQ8BIE6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd4aQ8BIE6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd4aQ8BIE6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd4aQ8BIE6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmd4aQ8BIE6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmd4aQ8BIE6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmd4aQ8BIE6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmd4aQ8BIE6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmd4aQ8BIE6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Frmd4aQ8BIE6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Frmd4aQ8BIE6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Frmd4aQ8BIE6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Frmd4aQ8BIE6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Frmd4aQ8BIE6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms