Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms