Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnphQ80U23 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnphQ80U23 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnphQ80U23 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnphQ80U23 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnphQ80U23 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnphQ80U23 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms