Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ifna12Q80SS5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ifna12Q80SS5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ifna12Q80SS5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ifna12Q80SS5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifna12Q80SS5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms