Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tfap2eQ6VUP9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tfap2eQ6VUP9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tfap2eQ6VUP9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms