Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc3bQ6PDC0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3bQ6PDC0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rundc3bQ6PDC0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rundc3bQ6PDC0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.9 ms