Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PnkdQ69ZP3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkdQ69ZP3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PnkdQ69ZP3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms