Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Taf6Q62311 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf6Q62311 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Taf6Q62311 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Taf6Q62311 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Taf6Q62311 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms