Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift88Q61371 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ift88Q61371 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift88Q61371 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ift88Q61371 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ift88Q61371 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ift88Q61371 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms