Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb6Q60692 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb6Q60692 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmb6Q60692 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms