Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc190Q3URK1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc190Q3URK1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc190Q3URK1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc190Q3URK1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc190Q3URK1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc190Q3URK1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc190Q3URK1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc190Q3URK1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc190Q3URK1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc190Q3URK1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc190Q3URK1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms