Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd27Q3UMR0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd27Q3UMR0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ankrd27Q3UMR0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd27Q3UMR0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms