Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lsg1Q3UM18 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsg1Q3UM18 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsg1Q3UM18 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lsg1Q3UM18 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsg1Q3UM18 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lsg1Q3UM18 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lsg1Q3UM18 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms