Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHA3

Spg11, Spatacsin, mousemouse

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg11Q3UHA3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Spg11Q3UHA3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spg11Q3UHA3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spg11Q3UHA3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Spg11Q3UHA3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms