Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mcrip1Q3UGS4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mcrip1Q3UGS4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mcrip1Q3UGS4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mcrip1Q3UGS4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms