Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf149Q3U2C5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf149Q3U2C5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rnf149Q3U2C5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Rnf149Q3U2C5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Rnf149Q3U2C5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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