Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf149Q3U2C5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf149Q3U2C5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rnf149Q3U2C5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf149Q3U2C5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf149Q3U2C5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf149Q3U2C5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms