Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRG0

Gm1604b, Gene model 1604B, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1604bQ3TRG0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm1604bQ3TRG0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm1604bQ3TRG0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm1604bQ3TRG0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm1604bQ3TRG0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm1604bQ3TRG0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm1604bQ3TRG0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm1604bQ3TRG0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm1604bQ3TRG0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm1604bQ3TRG0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm1604bQ3TRG0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm1604bQ3TRG0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm1604bQ3TRG0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1604bQ3TRG0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1604bQ3TRG0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm1604bQ3TRG0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm1604bQ3TRG0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms