Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmprss11cQ1JRP2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmprss11cQ1JRP2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmprss11cQ1JRP2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tmprss11cQ1JRP2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms