Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plac8l1Q08EJ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plac8l1Q08EJ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plac8l1Q08EJ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms