Protein–RNA interactions for Protein: Q06479

YLR352W, F-box protein YLR352W, yeastyeast

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR352WQ06479 YIL108WYIL108W 2091 nt7.37□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 GDA1YEL042W 1557 nt7.37□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.37□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.37□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.37□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 GGA2YHR108W 1758 nt7.36□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 RRP46YGR095C 672 nt7.36□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 REX2YLR059C 810 nt7.36□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 YLR280CYLR280C 351 nt7.36□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 YMR210WYMR210W 1350 nt7.35□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 RPL12BYDR418W 498 nt7.35□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 FZF1YGL254W 900 nt7.35□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 SPE4YLR146C 903 nt7.35□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 YMC2YBR104W 990 nt7.35□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 YPL277CYPL277C 1464 nt7.35□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 SAN1YDR143C 1833 nt7.34□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 YMR253CYMR253C 1245 nt7.34□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 ATO2YNR002C 849 nt7.34□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 YPL108WYPL108W 507 nt7.34□□□□□ -1.23
YLR352WQ06479 HRA1HRA1 564 nt7.33□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 FET4YMR319C 1659 nt7.32□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 AIM3YBR108W 2844 nt7.32□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 YFR020WYFR020W 699 nt7.32□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 NSE5YML023C 1671 nt7.32□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 GRH1YDR517W 1119 nt7.31□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.31□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 YJL160CYJL160C 864 nt7.31□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 PMT7YDR307W 1989 nt7.31□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 SRP54YPR088C 1626 nt7.3□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 SBP1YHL034C 885 nt7.3□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 FAF1YIL019W 1041 nt7.3□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 LEA1YPL213W 717 nt7.3□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 ABP1YCR088W 1779 nt7.3□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 ERR3YMR323W 1314 nt7.29□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 ERR1YOR393W 1314 nt7.29□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 ERR2YPL281C 1314 nt7.29□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 ATF1YOR377W 1578 nt7.29□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 MAS2YHR024C 1449 nt7.29□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 MRS4YKR052C 915 nt7.29□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 FCY1YPR062W 477 nt7.29□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 BUD9YGR041W 1644 nt7.29□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 MPA43YNL249C 1629 nt7.29□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 snR86snR86 1004 nt7.28□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 YPT11YNL304W 1254 nt7.28□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 YPL264CYPL264C 1062 nt7.28□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 DAL4YIR028W 1908 nt7.28□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 YNL040WYNL040W 1371 nt7.28□□□□□ -1.24
YLR352WQ06479 YFR006WYFR006W 1608 nt7.27□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 MRP1YDR347W 966 nt7.26□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 RMA1YKL132C 1293 nt7.26□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 HXT13YEL069C 1695 nt7.25□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 AQR1YNL065W 1761 nt7.24□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 CHS5YLR330W 2016 nt7.23□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 MSB3YNL293W 1902 nt7.23□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 SPS22YCL048W 1392 nt7.23□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 MKK1YOR231W 1527 nt7.23□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 YOR268CYOR268C 399 nt7.23□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 EDC2YER035W 438 nt7.22□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 GYP8YFL027C 1494 nt7.22□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 HSM3YBR272C 1443 nt7.21□□□□□ -1.25
YLR352WQ06479 YMR166CYMR166C 1107 nt7.21□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 HIS3YOR202W 663 nt7.2□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 YER152CYER152C 1332 nt7.2□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 AGP2YBR132C 1791 nt7.2□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 YFL052WYFL052W 1398 nt7.2□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 TOS2YGR221C 1869 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 GAS1YMR307W 1680 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 CMR1YDL156W 1569 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 GDH1YOR375C 1365 nt7.19□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 TMS1YDR105C 1422 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 PET18YCR020C 648 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 COG1YGL223C 1254 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 HMS2YJR147W 1077 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 LSP1YPL004C 1026 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 ADA2YDR448W 1305 nt7.18□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 GAA1YLR088W 1845 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 YER156CYER156C 1017 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 RRT14YIL127C 621 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 RSM7YJR113C 744 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 HXT9YJL219W 1704 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 PTC6YCR079W 1329 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 KDX1YKL161C 1302 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 MFG1YDL233W 1377 nt7.17□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 POB3YML069W 1659 nt7.16□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 YBL070CYBL070C 321 nt7.16□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.15□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.15□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.15□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.15□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.15□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.15□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.15□□□□□ -1.26
YLR352WQ06479 YBR056WYBR056W 1506 nt7.15□□□□□ -1.27
YLR352WQ06479 CDC13YDL220C 2775 nt7.14□□□□□ -1.27
YLR352WQ06479 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 55.5 ms