Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sox12Q04890 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sox12Q04890 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sox12Q04890 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sox12Q04890 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sox12Q04890 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sox12Q04890 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sox12Q04890 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Sox12Q04890 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sox12Q04890 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sox12Q04890 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sox12Q04890 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sox12Q04890 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Sox12Q04890 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Sox12Q04890 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Sox12Q04890 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Sox12Q04890 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sox12Q04890 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms