Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emx1Q04742 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Emx1Q04742 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Emx1Q04742 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Emx1Q04742 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Emx1Q04742 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Emx1Q04742 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Emx1Q04742 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Emx1Q04742 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Emx1Q04742 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Emx1Q04742 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Emx1Q04742 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Emx1Q04742 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Emx1Q04742 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Emx1Q04742 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms