Protein–RNA interactions for Protein: P83882

Rpl36a, 60S ribosomal protein L36a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl36aP83882 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl36aP83882 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl36aP83882 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl36aP83882 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl36aP83882 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl36aP83882 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl36aP83882 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl36aP83882 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl36aP83882 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl36aP83882 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl36aP83882 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl36aP83882 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl36aP83882 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl36aP83882 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms