Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ThraP63058 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ThraP63058 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ThraP63058 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ThraP63058 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ThraP63058 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ThraP63058 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ThraP63058 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ThraP63058 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ThraP63058 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ThraP63058 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ThraP63058 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ThraP63058 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ThraP63058 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ThraP63058 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ThraP63058 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ThraP63058 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ThraP63058 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ThraP63058 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ThraP63058 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ThraP63058 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ThraP63058 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ThraP63058 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ThraP63058 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ThraP63058 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ThraP63058 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ThraP63058 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ThraP63058 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ThraP63058 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ThraP63058 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ThraP63058 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ThraP63058 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ThraP63058 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ThraP63058 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ThraP63058 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ThraP63058 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ThraP63058 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ThraP63058 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ThraP63058 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ThraP63058 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ThraP63058 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ThraP63058 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ThraP63058 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ThraP63058 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ThraP63058 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ThraP63058 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ThraP63058 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThraP63058 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThraP63058 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThraP63058 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThraP63058 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThraP63058 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThraP63058 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ThraP63058 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ThraP63058 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ThraP63058 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ThraP63058 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ThraP63058 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ThraP63058 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ThraP63058 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ThraP63058 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ThraP63058 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ThraP63058 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ThraP63058 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ThraP63058 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ThraP63058 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ThraP63058 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ThraP63058 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ThraP63058 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ThraP63058 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ThraP63058 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ThraP63058 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ThraP63058 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ThraP63058 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ThraP63058 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ThraP63058 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ThraP63058 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThraP63058 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThraP63058 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThraP63058 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThraP63058 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ThraP63058 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ThraP63058 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ThraP63058 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ThraP63058 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ThraP63058 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ThraP63058 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ThraP63058 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ThraP63058 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ThraP63058 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ThraP63058 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ThraP63058 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ThraP63058 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ThraP63058 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ThraP63058 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ThraP63058 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ThraP63058 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ThraP63058 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ThraP63058 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ThraP63058 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms