Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpl30P62889 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl30P62889 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl30P62889 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl30P62889 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms