Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Efnb1P52795 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Efnb1P52795 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efnb1P52795 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Efnb1P52795 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Efnb1P52795 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms