Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa11P50709 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa11P50709 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa11P50709 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa11P50709 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Defa11P50709 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa11P50709 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa11P50709 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa11P50709 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa11P50709 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa11P50709 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 753 ms