Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa8P50706 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa8P50706 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa8P50706 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Defa8P50706 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Defa8P50706 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Defa8P50706 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa8P50706 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Defa8P50706 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Defa8P50706 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Defa8P50706 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa8P50706 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa8P50706 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Defa8P50706 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Defa8P50706 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa8P50706 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Defa8P50706 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms