Protein–RNA interactions for Protein: P48997

Ivl, Involucrin, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IvlP48997 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IvlP48997 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IvlP48997 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IvlP48997 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IvlP48997 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IvlP48997 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IvlP48997 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IvlP48997 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IvlP48997 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IvlP48997 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IvlP48997 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IvlP48997 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IvlP48997 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IvlP48997 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IvlP48997 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IvlP48997 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IvlP48997 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IvlP48997 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IvlP48997 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IvlP48997 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IvlP48997 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IvlP48997 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IvlP48997 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IvlP48997 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IvlP48997 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IvlP48997 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IvlP48997 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IvlP48997 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IvlP48997 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IvlP48997 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IvlP48997 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IvlP48997 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IvlP48997 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IvlP48997 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IvlP48997 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IvlP48997 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IvlP48997 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IvlP48997 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IvlP48997 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IvlP48997 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IvlP48997 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IvlP48997 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IvlP48997 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IvlP48997 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IvlP48997 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IvlP48997 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IvlP48997 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IvlP48997 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IvlP48997 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IvlP48997 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IvlP48997 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IvlP48997 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IvlP48997 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IvlP48997 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IvlP48997 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IvlP48997 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IvlP48997 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IvlP48997 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IvlP48997 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IvlP48997 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IvlP48997 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IvlP48997 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IvlP48997 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IvlP48997 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IvlP48997 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IvlP48997 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IvlP48997 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IvlP48997 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IvlP48997 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IvlP48997 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IvlP48997 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IvlP48997 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IvlP48997 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IvlP48997 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IvlP48997 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IvlP48997 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IvlP48997 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IvlP48997 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IvlP48997 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IvlP48997 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IvlP48997 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IvlP48997 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IvlP48997 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IvlP48997 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IvlP48997 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IvlP48997 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IvlP48997 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IvlP48997 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IvlP48997 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IvlP48997 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IvlP48997 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IvlP48997 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IvlP48997 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IvlP48997 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IvlP48997 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IvlP48997 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IvlP48997 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IvlP48997 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IvlP48997 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IvlP48997 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms