Protein–RNA interactions for Protein: P48997

Ivl, Involucrin, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IvlP48997 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
IvlP48997 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
IvlP48997 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IvlP48997 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
IvlP48997 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
IvlP48997 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
IvlP48997 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
IvlP48997 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
IvlP48997 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.82■■■■□ 3
IvlP48997 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
IvlP48997 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
IvlP48997 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
IvlP48997 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
IvlP48997 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
IvlP48997 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
IvlP48997 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IvlP48997 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
IvlP48997 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
IvlP48997 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IvlP48997 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IvlP48997 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
IvlP48997 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
IvlP48997 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
IvlP48997 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
IvlP48997 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
IvlP48997 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IvlP48997 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
IvlP48997 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
IvlP48997 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
IvlP48997 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
IvlP48997 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
IvlP48997 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
IvlP48997 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
IvlP48997 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
IvlP48997 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
IvlP48997 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
IvlP48997 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
IvlP48997 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
IvlP48997 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
IvlP48997 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
IvlP48997 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
IvlP48997 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
IvlP48997 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
IvlP48997 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
IvlP48997 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
IvlP48997 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
IvlP48997 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
IvlP48997 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
IvlP48997 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IvlP48997 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IvlP48997 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
IvlP48997 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IvlP48997 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
IvlP48997 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IvlP48997 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IvlP48997 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
IvlP48997 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IvlP48997 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IvlP48997 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IvlP48997 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IvlP48997 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
IvlP48997 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IvlP48997 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
IvlP48997 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IvlP48997 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
IvlP48997 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IvlP48997 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IvlP48997 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IvlP48997 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IvlP48997 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IvlP48997 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IvlP48997 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IvlP48997 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IvlP48997 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IvlP48997 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
IvlP48997 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IvlP48997 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IvlP48997 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
IvlP48997 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IvlP48997 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
IvlP48997 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IvlP48997 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
IvlP48997 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IvlP48997 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IvlP48997 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IvlP48997 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IvlP48997 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IvlP48997 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IvlP48997 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IvlP48997 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IvlP48997 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IvlP48997 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
IvlP48997 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IvlP48997 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IvlP48997 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IvlP48997 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IvlP48997 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IvlP48997 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IvlP48997 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IvlP48997 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms