Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prox1P48437 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prox1P48437 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prox1P48437 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prox1P48437 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prox1P48437 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prox1P48437 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prox1P48437 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prox1P48437 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prox1P48437 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prox1P48437 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prox1P48437 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prox1P48437 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prox1P48437 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prox1P48437 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prox1P48437 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prox1P48437 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prox1P48437 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prox1P48437 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prox1P48437 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox1P48437 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox1P48437 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prox1P48437 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox1P48437 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prox1P48437 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prox1P48437 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prox1P48437 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prox1P48437 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms