Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc11P31313 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc11P31313 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc11P31313 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxc11P31313 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms