Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp2P29594 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp2P29594 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp2P29594 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp2P29594 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp2P29594 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp2P29594 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp2P29594 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp2P29594 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp2P29594 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp2P29594 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp2P29594 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp2P29594 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp2P29594 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms