Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa5P28312 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa5P28312 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa5P28312 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa5P28312 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa5P28312 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa5P28312 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa5P28312 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa5P28312 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa5P28312 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa5P28312 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa5P28312 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa5P28312 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa5P28312 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa5P28312 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms