Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtmaP26350 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtmaP26350 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtmaP26350 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtmaP26350 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtmaP26350 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtmaP26350 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtmaP26350 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtmaP26350 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtmaP26350 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtmaP26350 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtmaP26350 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtmaP26350 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtmaP26350 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PtmaP26350 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtmaP26350 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtmaP26350 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtmaP26350 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms