Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp42P22227 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp42P22227 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp42P22227 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp42P22227 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp42P22227 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp42P22227 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp42P22227 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp42P22227 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp42P22227 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp42P22227 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp42P22227 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp42P22227 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp42P22227 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp42P22227 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp42P22227 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms