Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP10400 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP10400 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PolP10400 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PolP10400 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PolP10400 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP10400 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP10400 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PolP10400 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP10400 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP10400 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP10400 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PolP10400 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP10400 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP10400 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP10400 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP10400 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP10400 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP10400 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP10400 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP10400 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP10400 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP10400 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP10400 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PolP10400 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP10400 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP10400 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP10400 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PolP10400 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP10400 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP10400 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP10400 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP10400 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP10400 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP10400 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PolP10400 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP10400 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP10400 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PolP10400 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PolP10400 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PolP10400 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP10400 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP10400 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP10400 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PolP10400 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP10400 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP10400 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP10400 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP10400 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP10400 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP10400 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP10400 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP10400 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP10400 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP10400 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP10400 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP10400 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP10400 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP10400 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP10400 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP10400 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP10400 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP10400 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP10400 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP10400 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP10400 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP10400 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP10400 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP10400 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP10400 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP10400 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP10400 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP10400 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP10400 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP10400 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP10400 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP10400 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP10400 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP10400 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP10400 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP10400 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP10400 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP10400 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP10400 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP10400 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP10400 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP10400 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP10400 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP10400 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP10400 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP10400 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PolP10400 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP10400 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP10400 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PolP10400 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP10400 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP10400 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP10400 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP10400 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PolP10400 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms