Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q1

Ccdc153, Coiled-coil domain-containing protein 153, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc153P0C7Q1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc153P0C7Q1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc153P0C7Q1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc153P0C7Q1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc153P0C7Q1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc153P0C7Q1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc153P0C7Q1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc153P0C7Q1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc153P0C7Q1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms