Protein–RNA interactions for Protein: O89019

Invs, Inversin, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InvsO89019 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
InvsO89019 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
InvsO89019 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
InvsO89019 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
InvsO89019 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
InvsO89019 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
InvsO89019 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
InvsO89019 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
InvsO89019 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
InvsO89019 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
InvsO89019 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
InvsO89019 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
InvsO89019 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
InvsO89019 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
InvsO89019 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
InvsO89019 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
InvsO89019 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
InvsO89019 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
InvsO89019 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
InvsO89019 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
InvsO89019 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
InvsO89019 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
InvsO89019 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
InvsO89019 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
InvsO89019 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
InvsO89019 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
InvsO89019 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
InvsO89019 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
InvsO89019 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
InvsO89019 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
InvsO89019 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
InvsO89019 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
InvsO89019 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
InvsO89019 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
InvsO89019 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
InvsO89019 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
InvsO89019 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
InvsO89019 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
InvsO89019 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
InvsO89019 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
InvsO89019 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
InvsO89019 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
InvsO89019 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
InvsO89019 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
InvsO89019 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
InvsO89019 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
InvsO89019 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
InvsO89019 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
InvsO89019 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
InvsO89019 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
InvsO89019 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
InvsO89019 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
InvsO89019 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
InvsO89019 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
InvsO89019 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
InvsO89019 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
InvsO89019 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
InvsO89019 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
InvsO89019 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
InvsO89019 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
InvsO89019 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
InvsO89019 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
InvsO89019 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
InvsO89019 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
InvsO89019 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
InvsO89019 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
InvsO89019 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InvsO89019 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InvsO89019 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InvsO89019 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InvsO89019 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InvsO89019 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
InvsO89019 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InvsO89019 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
InvsO89019 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
InvsO89019 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
InvsO89019 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
InvsO89019 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
InvsO89019 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
InvsO89019 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
InvsO89019 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
InvsO89019 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
InvsO89019 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
InvsO89019 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
InvsO89019 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
InvsO89019 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
InvsO89019 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
InvsO89019 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
InvsO89019 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
InvsO89019 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
InvsO89019 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
InvsO89019 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
InvsO89019 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
InvsO89019 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
InvsO89019 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
InvsO89019 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
InvsO89019 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
InvsO89019 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
InvsO89019 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
InvsO89019 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 635 ms