Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp9O88851 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp9O88851 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rbbp9O88851 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rbbp9O88851 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms