Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClppO88696 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClppO88696 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClppO88696 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClppO88696 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClppO88696 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClppO88696 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClppO88696 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClppO88696 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClppO88696 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClppO88696 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClppO88696 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClppO88696 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClppO88696 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClppO88696 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClppO88696 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClppO88696 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClppO88696 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClppO88696 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClppO88696 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ClppO88696 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClppO88696 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClppO88696 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClppO88696 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClppO88696 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClppO88696 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClppO88696 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClppO88696 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClppO88696 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClppO88696 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClppO88696 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClppO88696 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClppO88696 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClppO88696 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ClppO88696 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClppO88696 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClppO88696 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClppO88696 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClppO88696 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClppO88696 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClppO88696 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClppO88696 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClppO88696 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClppO88696 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClppO88696 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClppO88696 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ClppO88696 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ClppO88696 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClppO88696 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClppO88696 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClppO88696 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClppO88696 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClppO88696 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClppO88696 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClppO88696 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClppO88696 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClppO88696 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClppO88696 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ClppO88696 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClppO88696 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClppO88696 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClppO88696 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClppO88696 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClppO88696 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClppO88696 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClppO88696 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClppO88696 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClppO88696 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClppO88696 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClppO88696 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClppO88696 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ClppO88696 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClppO88696 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClppO88696 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClppO88696 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClppO88696 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClppO88696 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ClppO88696 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClppO88696 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClppO88696 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClppO88696 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClppO88696 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClppO88696 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClppO88696 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClppO88696 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClppO88696 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClppO88696 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ClppO88696 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClppO88696 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClppO88696 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClppO88696 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ClppO88696 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClppO88696 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClppO88696 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClppO88696 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClppO88696 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClppO88696 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClppO88696 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ClppO88696 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClppO88696 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.5 ms