Protein–RNA interactions for Protein: O35709

Enc1, Ectoderm-neural cortex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Enc1O35709 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Enc1O35709 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Enc1O35709 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Enc1O35709 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Enc1O35709 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Enc1O35709 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Enc1O35709 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Enc1O35709 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Enc1O35709 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Enc1O35709 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Enc1O35709 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Enc1O35709 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Enc1O35709 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Enc1O35709 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Enc1O35709 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Enc1O35709 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Enc1O35709 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Enc1O35709 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Enc1O35709 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Enc1O35709 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Enc1O35709 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms