Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clcn6O35454 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn6O35454 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn6O35454 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcn6O35454 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn6O35454 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn6O35454 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn6O35454 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn6O35454 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn6O35454 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn6O35454 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn6O35454 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn6O35454 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clcn6O35454 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clcn6O35454 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn6O35454 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms